经典理论：快效抑菌剂与繁殖期杀菌剂联合可产生拮抗作用。因繁殖期杀菌剂可与细菌细胞壁粘肽合成中的转肽酶结合，抑制氨基酸的交叉连接，影响细胞壁粘肽的合成；而速效抑菌剂能促进细菌细胞壁粘肽对氨基酸的提取，从而加速细菌细胞壁的合成，与前者的作用正好相反。此外，前者对繁殖旺盛的细菌作用最强，对静止期的细菌抗菌作用甚微或无作用。而后者能迅速抑制细菌蛋白质的合成，使细菌由繁殖期进入静止期，从而减弱前者的抗菌作用，故应避免联用。近年，这一观点受到质疑，大量的研究证据表明，杀菌剂如头孢菌素类与抑菌剂如大环内酯类（后者对气道变态反应性疾病有抗炎作用，与免疫系统有协同作用）联用治疗许多感染，尤其是一些严重的或难治性感染，效果良好。有报道认为二者联用可提高治疗菌血症性肺炎的疗效，单用二者之一的对照组死亡率明显高于二药联合组。
从缩短起效时间考虑杀菌剂与抑菌剂伍用顺序存在二种情况：
一、先杀后抑：非细菌生物被膜（bacterial biofilm，BF）细菌感染性疾病，按照传统理论，一般情况杀菌剂与抑菌剂伍用应是“先杀后抑”。
二、先溶后杀：生物医学材料相关感染形成的细菌生物被膜病，应该注意抗菌药物难以渗透。一般“先溶后杀”。由于生物被膜相关的感染性疾病的治疗十分棘手，目前主要有两种策略：
１．抑制生物被膜的形成；
２．在治疗过程中尽量选用能透过生物被膜的杀菌剂。在临床常用的抗生素中，氟罗沙星、加替沙星等喹诺酮类药物对细菌生物被膜有较好的渗透性，对生物被膜下生长缓慢的细菌也有的杀菌作用；克拉霉素、阿奇霉素、罗红霉素等大环内酯类药物可抑制细菌生物被膜的形成，与氟喹诺酮类药物联用时，可提高后者对细菌生物被膜的渗透性和对被膜下细菌的杀菌活性。
三、给药间隔：＞1h，最好应根据繁殖期杀菌剂的半衰期确定抑菌剂使用的时间，一般来说，抑菌剂可以在杀菌剂两次使用之间使用。如下呼吸道细菌性严重感染，经验用药，尤其适用不愿住院的门诊患者，可以每天静脉滴注一次头孢曲松+阿奇霉素，依从性最佳。该二药属于时间依赖性抗菌药，头孢菌素给药频次多，一天可能需要2～3次（头孢曲松除外），阿奇霉素半衰期长（近70小时）每天一次即可。
总之，按疗程连续伍用抗菌药使得用药顺序模糊，但用药顺序可影响起效时间，进而可能延误救治重症感染患者时机。