最近,美国学者Chanjae Park等研究发现,胃肠平滑肌细胞(SMC)表型,被调节血清反应因子(SRF)、MYOCD,和ELK1的表达的SRF依赖性SMC表型miRNA所控制。相关报道发表于《胃肠病学》(Gastroenterology)杂志。 SMC在多种病理生理条件下会改变表型。这些改变在很大程度上受到SRF的调节,该因子为一种结合于平滑肌收缩基因的CC (A/T)6 GG (CArG)盒的转录因子。而SMC miRNA转录组(SMC miRNA组)和SRF对它的调节目前却并不明确。 研究者们采用大规模并行测序,识别小鼠和人的胃肠SMC的miRNA转录组。并通过敲低SRF和芯片分析确认,SMC的miRNA转录组的定位用以识别所有CArG盒。分化和增殖的SMC中的SMC表型miRNA通过定量聚合酶链反应鉴定。生物信息学和目标验证分析显示SMC表型受SRF依赖性SMC表型miRNA调节。 胃肠miRNA转录组,经小鼠和人细胞的全基因组分析、克隆并鉴定。平滑肌miRNA组由几百种在两种物种间高度保守的独特的miRNA构成。研究人员定位了miRNA的CArG盒,并发现很多都在平滑肌miRNA组中有一个SRF依赖性签名。平滑肌miRNA 的CArG盒有一些鲜明的特征。此外,研究人员还鉴定了约100个由分化或增殖的SMC诱导出的SMC表型miRNA;并发现SRF依赖性SMC表型miRNA结合并调节Srf和其辅因子,myocadin(Myocd)和ETS癌基因家族的Elk1。来源:医学论坛网 |
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